Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXE3Q13461 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXE3Q13461 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXE3Q13461 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms