Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE3BQ13370 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms