Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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