Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRDM2Q13029 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM2Q13029 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
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