Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms