Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms