Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms