Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms