Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms