Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPB1Q06547 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms