Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSME1Q06323 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms