Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBE1Q04446 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GBE1Q04446 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms