Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAV1Q03135 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAV1Q03135 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms