Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms