Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OTUD4Q01804 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
OTUD4Q01804 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms