Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms