Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms