Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms