Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRB1P82279 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRB1P82279 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRB1P82279 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms