Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms