Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms