Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms