Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11AP62491 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms