Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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