Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK11-1P61568 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK11-1P61568 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms