Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms