Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTBP60709 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms