Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB15P59190 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB15P59190 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB15P59190 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB15P59190 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms