Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSX2P58304 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSX2P58304 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSX2P58304 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSX2P58304 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VSX2P58304 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSX2P58304 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms