Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP4P57796 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABP4P57796 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABP4P57796 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABP4P57796 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CABP4P57796 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CABP4P57796 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms