Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBASH3AP57075 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBASH3AP57075 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms