Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK1P57059 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK1P57059 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK1P57059 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms