Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP7P55210 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP7P55210 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP7P55210 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms