Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB3P54284 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms