Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A2P52657 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms