Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGDP52209 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGDP52209 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGDP52209 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms