Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LUMP51884 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LUMP51884 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms