Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLCSP50747 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLCSP50747 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLCSP50747 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms