Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERFP50548 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERFP50548 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERFP50548 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERFP50548 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERFP50548 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERFP50548 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms