Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTBP49356 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms