Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX1P48742 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX1P48742 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX1P48742 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms