Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME1P48163 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME1P48163 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ME1P48163 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME1P48163 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms