Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-1P43699 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms