Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPD2P43304 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPD2P43304 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPD2P43304 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPD2P43304 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPD2P43304 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms