Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms