Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms