Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM5P33992 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM5P33992 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM5P33992 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM5P33992 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms