Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms