Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARCKSP29966 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms