Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP1P29466 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP1P29466 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP1P29466 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP1P29466 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP1P29466 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP1P29466 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP1P29466 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms